玛纳斯国家湿地公园管理局成立于2011年，副县级单位，单位办公地点位于玛纳斯县农业综合楼三楼，单位内设科室4个，行政办公室、野生动植物保护科、产业科、湿地保护科，在编在岗干部职工12人（其中副县级人员2人、正科级人员2人、副科级人员3人、专业技术岗人员2人、工勤人员2人）。